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　京都府立医科大学、京都府立大学を束ねる京都府公立大学法人の30年度予算によると、予算規模は本部２億７４００万円（対前年度比０・８％減）、医大６５億２７００万円（同０・９％増）、病院２８９億９８００万円（同５・３％増）、北部（北部医療センター）６７億９８００万円（同０・１％増）、府大３６億７２００万円（同３・５％減）の計４６２億６９００万円（同３・１％増）。
　30年度予算の重点事業は、府立医大では教育環境改善費に５８８万７０００円を計上。基礎医学学舎及び看護学舎のトイレ等の改修及び附属図書館閲覧室を日曜開館し学生教育環境の改善を図る。
　新規で保健看護学研究科博士後期課程学習環境整備費に２６０万円を計上し、学習環境の整備として基本教室のＡＶ機器を整備。
　中央研究室大型研究機器整備費に２３７０万円を計上。実験動物センターの高圧蒸気滅菌器１台を更新し、研究環境の改善を図る。
　附属病院では、手術室機能強化費に１億９０００万円を計上。手術待ち状態の改善を図るため、中央診療棟５階の現手術室（12室）周辺に２室増室する。
　精神科病棟整備事業費に４億２１００万円（Ｄ３改修工事費２億９７００円（府借入金）、北病棟解体工事費１億２４００万円（受託事業））を計上。精神科病棟の療養環境向上を図るため、既存病棟の改修・移転を実施するとともに、移転後の北病棟を解体する。
　最先端がん治療研究センター運営費に２億０７９７万円を計上。30年度中の治療開始に向けた施設管理費等維持運営費に充てる。
　附属病院医療機器整備費に５億３０００万円（手術室機能強化費分２億１０００万円含む）を計上し、老朽化した診療機器等の順次更新を図る。
　北部医療センターでは、北部医療センター医療機器整備費に８０００万円を計上。老朽化した診療機器の順次更新を図る。
　共通では、施設設備改良費に３億３９００万円を計上。老朽化した施設設備を順次更新を図るとし、附属病院の病棟空調用冷温水発生機更新事業費に３億１９００万円、基礎医学学舎の直流電源装置蓄電池更新事業費に２０００万円を充てる。
　府立大学では、和食文化高等教育機関設置推進費に４５００万円を計上。31年度の和食文化学科（仮称）開設に向け、体制整備や文部科学省へ届出等を行う。
　臨時・新規で耐震未対応学舎対策事業費に１１８０万円を計上。Ｉｓ値が最低値の４号館から２号館へ研究室を移転する。
　臨時・新規で老朽設備緊急対策事業費に２０００万円を計上。31年度に法定廃棄処分期限を迎える高濃度ＰＣＢ含有コンデンサーの調査処分及びそれに伴う受変電設備更新を行う。