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　京都市教育委員会は、令和７年度の開校を目指し、小栗栖中学校区小中一貫教育校の整備に向けた準備を進める。
　伏見区小栗栖中学校区の３つの小学校（小栗栖小学校、小栗栖宮山小学校及び石田小学校）と小栗栖中学校の計４校を一体化した施設一体型小中一貫教育校を新設する計画。
　整備手順は、�@小栗栖小学校既存校舎、体育館及びプール（付属棟含む）を解体撤去�A既存校舎等を解体撤去した後、小栗栖小学校敷地内に新校舎を建設�B新校舎建設工事と並行してグラウンド整備工事を実施�C新校舎建設工事の完了後に小栗栖中学校敷地の建物を解体撤去�D小栗栖小学校敷地と小栗栖中学校敷地をつなぐ陸橋（歩道橋）を建設。
　新校舎は、ＲＣ造＋Ｗ造＋Ｓ造３階建、延約１万４０００�u（建築面積約６７３９�u）で、建物高さ約16・０ｍを想定。建設地は小栗栖小学校敷地の伏見区小栗栖森本町47−４の敷地約１万４２１０�u。三角形の敷地形状を活かし、北側に体育館棟を配置、南側に校舎棟をＶ字型に配置し、三角形配置とする予定。２階上部に屋外プールを配する。
　小栗栖小と石田小の２校を石田小敷地において令和４年度に一次統合し、その校名を石田小とする。市は令和２年２月市会に一次統合のための小学校条例の一部改正案を提出し、原案通り可決した。新校舎の建設工事期間中の児童は、計画地外の石田小へ移動する。
　令和２年度に基本計画を公募型簡易プロポーザル方式により、類設計室（大阪市淀川区）に決め、同社でとりまとめ。ＷＴＯ対象の基本設計・実施設計を公募型プロポーザル方式により、同社に決定した。履行期間は令和５年３月15日まで。
　同社の技術提案書によると「子ども・地域・産地を育む、みやこ杣木に包まれた学び舎」として、�@子どもと地域が一体となり共に学びあう拠点�A子どもの健やかな身体と心をはぐくむ木育の学び舎�Bみやこ杣木を積極活用し産地を活性化�C選択と集中による確かなコスト管理の４点を基本方針に設定。
　普通教室は学年単位で集約した学年ユニットを構成し、特別教室は同種の教科を集約した教科ユニットを構成。各ユニットに「コモンズ」を設け、グループワークや協働作業が可能なワークスペース、調べ学習が行える図書スペースなど、対話・協働型の学びを促進する機能を配置する。多目的室は２・３階中央に設け、各学年から訪れやすい配置とし、異学年の交流・学びを促進する。メディアセンターは地域や異学年の日常的な交流の場となるよう、教室や地域出入口からアクセスしやすい１階中央に配置する。ランチルームや中庭、地域ギャラリーを隣接させ、多様な活動が展開できる計画とする。
　南方面からの通学に利用する陸橋（歩道橋）は、溜まり空間の確保と安全性に配慮した階段寸法・幅員を検討する。
　その他配慮事項は、▽南・西門ともに正門とする地元要望を踏まえ、両面から等距離のグラウンド側に昇降口を配置▽南北一体の土地利用を促進するため、陸橋計画を踏まえた動線検討と、中学校敷地のスポーツゾーン検討▽近年頻発する猛暑の熱中症の予防対策としてプールへの膜屋根の設置を検討▽環境配慮施設としてＣＡＳＢＥＥ京都Ａランク以上を目標等。
　令和３年度は、設計を進める一方、建設地の小栗栖小敷地の地質調査を第１四半期（４月〜６月）に入札し、委託する。工期は３ヵ月。概算額区分は１０００万円以上ＷＴＯ対象未満。
　また、新小栗栖街道を跨いで小栗栖小と小栗栖中をつなぐ陸橋（歩道橋）の予備設計と橋梁詳細設計を第１四半期（４月〜６月）に入札し、委託する。工期は３ヵ月。概算額区分は１０００万円以上ＷＴＯ対象未満。
　小栗栖小の既存校舎等の解体も計画。第４四半期（令和４年１月〜３月）に入札する予定。解体対象は（北校舎）ＲＣ造＋Ｓ造３階建、延約２１６０�u、（南校舎）ＲＣ造３階建、延２１８０�u、（新棟）ＲＣ造４階建、延約１５３０�u、（体育館）ＲＣ造平屋建、約４９０�u、（プール棟）ＲＣ造平屋建、約６４０�u、（プール更衣室、プール機械室）Ｓ造平屋建、約40�u、（その他付属施設（倉庫、渡り廊下、受水槽等）Ｓ造平屋建、約２３０�u。工期は８ヵ月。概算額区分は１億円以上４億円未満。
　令和４年度は小栗栖小解体撤去工事を進めるとともに、西門橋梁建設工事を予定。令和５年度は小栗栖中学校プール解体撤去工事（プール棟がＲＣ造平屋建、約５８０�u、更衣室棟が補強ＣＢ造平屋建、約40�u、機械室棟が補強ＣＢ造平屋建、約20�u、倉庫棟が補強ＣＢ造平屋建、約30�u）を実施する。令和５〜６年度に新校舎建設工事、陸橋（歩道橋）建設工事を行い、令和６年度にグラウンド整備工事を実施し、７年度の開校を目指す。開校時の児童・生徒は５４０人程度、その他教職員は40人程度を想定。